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                科研進展

                我園在增強子-啟動子互作介導的大豆響應光照調控的分子機制研究中取得重要進展

                作者: 生物信息學及功能基因發掘:黃銘坤  來源:原創  發布時間:2024-01-10  瀏覽數:1388  
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                增強子(Enhancer)是一種重要的非編碼 DNA 調控元件,可通過轉錄因子介導,與近端啟動子相互作用調控遠端基因表;光照是植物的主要能量來源,也是植物生長發育和生存的重要環境因子。因此,了解植物如何通過增強子調控基因表達以應對光照的作用,可能對未來利用增強子調控作物生產至關重要。然而相關研究目前在大豆中報道比較有限。為了進一步解析大豆增強子調控的分子機制,研究人員利用靶向染色質開放的測序技術(ATAC-seq),對大豆黃化苗進行測序,通過與光照培養的幼苗進行對比,篩選出潛在的光響應的大豆增強子元件,進一步利用ATAC-seq Footprint技術,鑒定潛在調控這些增強子的轉錄因子,并通過酵母單雜交(Y1H)、雙分子熒光互補(BiFC)、染色質構象捕獲(3C-qPCR)技術,最終推出轉錄因子-增強子-啟動子互作形成復合體介導染色質形成環狀結構(Loop)調控下游基因表達的分子模型。這項研究也是大豆光響應增強子調控基因表達的首次報道。最終成果于2023年9月,在植物學經典雜志Plant Physiology上以 “Molecular evidence for enhancer–promoter interactions in light responses of soybean seedlings”為題進行了發表,中國科學院廬山植物園黃銘坤副研究員與香港中文大學林漢明(Lam Hon-Ming)教授為論文的共同通訊作者,中國科學院廬山植物園為第一單位。

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